174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2223 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
158 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  65.36 
 
 
158 aa  198  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  61.44 
 
 
163 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  55.56 
 
 
158 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  61.11 
 
 
164 aa  160  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  59.18 
 
 
152 aa  158  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  53.33 
 
 
167 aa  157  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1523  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.33575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  46 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  42.96 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  40.3 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  38.97 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  41.01 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  38.19 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  42.28 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  37.82 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  35.62 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  42.45 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  35.37 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  35.85 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.58 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  37.06 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  38.81 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  37.78 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  38.96 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.81 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  37.93 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  38.04 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  37.06 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  36.76 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  37.93 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  39.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  38.13 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.29 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  35.62 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  34.01 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  36.84 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  39.6 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  41.01 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  36.31 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  34.07 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  38.64 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  37.69 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  37.09 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  34.97 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  34.97 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  34.81 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  37.59 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  36.69 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  35.86 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.18 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  36.3 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  32.87 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  34.21 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  34.53 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  32.26 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  32.9 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  35.42 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  36.23 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  34.96 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>