174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0292 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  42.96 
 
 
160 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  32.68 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  32.68 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  32.68 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.09 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  38 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  37.33 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  31.37 
 
 
167 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  34.21 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  36.67 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.76 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.76 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.76 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  33.99 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  34.39 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  30.82 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  34.87 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  33.77 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  35.85 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  35.53 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  33.99 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.13 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 
164 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  32.12 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  34.18 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  32.03 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  34.81 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  32.12 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  32.47 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  38.56 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  33.99 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  34.67 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  34.42 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  32.03 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  30.99 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  32.56 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  35.21 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  34.75 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  32.21 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  31.37 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  29.93 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  35.17 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  30.99 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  30.72 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  30.72 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  33.77 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  28.65 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  31.79 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  30.54 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  28.48 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  36.49 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  33.76 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  31.29 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  30.26 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  36.91 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  37.59 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  29.65 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  35.57 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  34.69 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  38.73 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  36.96 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>