174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0142 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  75.17 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  62.76 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  62.07 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  62.07 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  55.3 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  49.64 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  52.86 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  52.86 
 
 		 195 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  46.21 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  46.21 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  46.21 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  46.21 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  52.14 
 
 		 195 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  47.1 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  43.15 
 
 		 167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  43.57 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  40.88 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  48.89 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  43.94 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  43.94 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  47.76 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  43.7 
 
 		 164 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  40.41 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  42.42 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  41.1 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  37.86 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  47.41 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  40.44 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  39.01 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  39.01 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  43.94 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  39.01 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  43.51 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  39.13 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 168 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  43.48 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  48.15 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  43.7 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  40.91 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  41.96 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  41.96 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  42.96 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  45.65 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  44.93 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  42.03 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  37.78 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  39.01 
 
 		 180 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.88 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.17 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  44.44 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  42.65 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  43.7 
 
 		 191 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  45.45 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  36.11 
 
 		 186 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  40.58 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  43.88 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  44.62 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2321  phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins-like  40.52 
 
 		 185 aa  87  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  40.15 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 		 178 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0222  phosphatidylglycerophosphatase A  38.82 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  37.96 
 
 		 183 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  36.73 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>