173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0929 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 162 aa  314  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 162 aa  314  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  54.14 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  52.29 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  48 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  48.5 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  48.5 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  51.63 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  49.01 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  49.7 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  51.92 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  51.97 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  48.41 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  51.97 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  51.97 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  47.13 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  47.31 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  47.77 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  47.77 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  46.79 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  46.5 
 
 		 171 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  44.37 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  45.86 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  50.68 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  45.7 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  47.62 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  50.66 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  49.32 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  49.32 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  51.02 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  44.59 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  49.32 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  45.22 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  47.26 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  48.34 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  48.05 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  47.68 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  51.32 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  45.21 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  49.01 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  45.89 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  45.89 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  44.74 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  51.72 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  48.32 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  48.61 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  45.86 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 210 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  43.59 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  44.76 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  43.66 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  49.67 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  45.45 
 
 		 181 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  41.96 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  44.05 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.52 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  42.24 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  44.03 
 
 		 183 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  39.86 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  40.26 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0709  phosphatidylglycerophosphatase A  41.61 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  40.37 
 
 		 181 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  40.56 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  39.61 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  38.61 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  40.56 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  42.38 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  39.16 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0344  phosphatidylglycerophosphatase A  41.56 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  36.36 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0355  phosphatidylglycerophosphatase  41.56 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  34.62 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  39.38 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  39.38 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  39.1 
 
 		 193 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  38.71 
 
 		 175 aa  87  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  38.75 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  38.82 
 
 		 191 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  38.75 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  39.1 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>