174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1193 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 164 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  81.99 
 
 		 164 aa  262  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  80.37 
 
 		 166 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  80.37 
 
 		 164 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  80.37 
 
 		 164 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  77.78 
 
 		 164 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  79.27 
 
 		 164 aa  258  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  79.75 
 
 		 164 aa  257  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  77.78 
 
 		 164 aa  251  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  79.75 
 
 		 166 aa  237  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  71.43 
 
 		 163 aa  230  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  78.48 
 
 		 165 aa  226  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  76.43 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  75.47 
 
 		 164 aa  223  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  73.17 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  74.85 
 
 		 164 aa  222  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  60.39 
 
 		 162 aa  183  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  65.58 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  65.25 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  58.11 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  55.48 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  52.2 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  55.48 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  54.73 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  55.41 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  53.7 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 168 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 167 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  56.05 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  55.17 
 
 		 171 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  55.86 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  52.74 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  56.03 
 
 		 157 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  53.1 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  51.57 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  54.25 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  55.17 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  52.67 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  51.61 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  50.96 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  55.94 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  50.96 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  53.79 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  55.41 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  54.19 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  45 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  51.03 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  47.97 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  48.08 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  44 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  47.68 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  47.68 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  45.64 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  47.4 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  47.76 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  44.6 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  41.03 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  43.94 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  45.67 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  45.67 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  44.06 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  38.78 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  42.68 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  45.04 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  44.78 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  38.86 
 
 		 193 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 192 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  39.33 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  41.67 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  42.24 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  46.51 
 
 		 195 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  46.51 
 
 		 195 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  38 
 
 		 181 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  49.19 
 
 		 183 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 207 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  37.41 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  39.88 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0894  phosphatidylglycerophosphatase A  44.83 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0879413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  45.74 
 
 		 195 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  38.56 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  38.56 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>