174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00366 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  99.41 
 
 
169 aa  338  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  99.4 
 
 
168 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  94.64 
 
 
168 aa  326  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  94.64 
 
 
168 aa  326  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  94.05 
 
 
168 aa  325  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  94.05 
 
 
168 aa  324  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  94.05 
 
 
168 aa  324  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  85.89 
 
 
164 aa  293  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  82.21 
 
 
178 aa  288  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  75 
 
 
161 aa  264  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  75 
 
 
161 aa  264  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  75 
 
 
161 aa  264  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  75.6 
 
 
170 aa  240  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  77.64 
 
 
168 aa  240  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  55.06 
 
 
167 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  52.53 
 
 
168 aa  185  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  55.06 
 
 
167 aa  184  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  54.73 
 
 
164 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  52.83 
 
 
164 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  52.35 
 
 
164 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  50.31 
 
 
164 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  51.25 
 
 
164 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  51.61 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  54.55 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  51.61 
 
 
168 aa  161  3e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  51.25 
 
 
174 aa  160  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  55.78 
 
 
159 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  52.7 
 
 
164 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  52.7 
 
 
166 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  52.7 
 
 
164 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  52.35 
 
 
164 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  52.7 
 
 
164 aa  158  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  52.7 
 
 
164 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  49.01 
 
 
157 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  53.55 
 
 
164 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  45.51 
 
 
166 aa  153  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  53.38 
 
 
164 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  54.05 
 
 
166 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  56.52 
 
 
167 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  54.35 
 
 
160 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  56.52 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  52.82 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  56.52 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  55.8 
 
 
167 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  55.07 
 
 
167 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  53.69 
 
 
159 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  52.6 
 
 
171 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  52.6 
 
 
171 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  50.7 
 
 
157 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  55.07 
 
 
159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  53.62 
 
 
177 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  46.45 
 
 
161 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  46.1 
 
 
163 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  50.65 
 
 
164 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  47.06 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  46.32 
 
 
160 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  43.75 
 
 
181 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 
162 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 
162 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 
167 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  41.83 
 
 
180 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  44.97 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  41.25 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  39.47 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  41.5 
 
 
192 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  41.5 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  41.1 
 
 
193 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
213 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  40.41 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  41.1 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  40.69 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  39.73 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 
181 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
178 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
178 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
205 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
205 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
205 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
205 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  38.26 
 
 
205 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  42.47 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  41.89 
 
 
188 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  39.16 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  38.36 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  39.57 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 
160 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
145 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  41.61 
 
 
159 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
149 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
149 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  38.69 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>