159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3666 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 185 aa  360  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  73.96 
 
 		 181 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  68.16 
 
 		 193 aa  236  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0484  phosphatidylglycerophosphatase A  67.63 
 
 		 175 aa  228  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0709  phosphatidylglycerophosphatase A  69.41 
 
 		 166 aa  223  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  60.11 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0211  phosphatidylglycerophosphatase  61.17 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.627507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0344  phosphatidylglycerophosphatase A  69.51 
 
 		 176 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0355  phosphatidylglycerophosphatase  69.51 
 
 		 176 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  63.19 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3920  phosphatidylglycerophosphatase A  56.82 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  54.71 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  50.84 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  54.22 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  53.61 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  51.19 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  48.11 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  51.76 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  50.6 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  48.11 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0244  phosphatidylglycerophosphatase A  48.37 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  51.79 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  48.31 
 
 		 178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  48.35 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  51.19 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  51.19 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  50.57 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  50 
 
 		 154 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0222  phosphatidylglycerophosphatase A  44.94 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  50.31 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  47.62 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  43.26 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  37.65 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  39.88 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  37.43 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  39.35 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  39.88 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  43.24 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  43.24 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  43.24 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  39.11 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  40.24 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  40.38 
 
 		 157 aa  98.6  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  38.55 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  41.89 
 
 		 177 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  38.86 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  41.89 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  39.41 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.98 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.53 
 
 		 164 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  36.78 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  38.04 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  39.62 
 
 		 164 aa  94.4  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  44.52 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  39.53 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  41.83 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  41.83 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  41.4 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  41.83 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  42.11 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  39.51 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  45.57 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 168 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  37.74 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  37.74 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  37.74 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  37.74 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  38.99 
 
 		 164 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  37.74 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  38.65 
 
 		 159 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  38.61 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  37.42 
 
 		 168 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  39.38 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>