174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1102 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 164 aa  320  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  96.34 
 
 		 164 aa  291  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  91.19 
 
 		 164 aa  291  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  95.09 
 
 		 164 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  85.53 
 
 		 166 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  85.53 
 
 		 164 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  85.53 
 
 		 164 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  85.53 
 
 		 164 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  82.72 
 
 		 164 aa  267  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  80.37 
 
 		 164 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  79.63 
 
 		 164 aa  259  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  77.07 
 
 		 163 aa  249  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  76.73 
 
 		 164 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  79.62 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  82.39 
 
 		 166 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  78.75 
 
 		 165 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  69.8 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  68.97 
 
 		 162 aa  190  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  61.74 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  62.91 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  57.76 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  56.88 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  56.46 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  56.46 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  56.52 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  56.46 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  55.28 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  52.87 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  53.74 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  58.16 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  54.05 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  54.05 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  53.38 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 169 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 168 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  53.38 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  52.63 
 
 		 178 aa  166  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  53.02 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  54.05 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  54.17 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  54.17 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  54.17 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  50.64 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  52.6 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  52.08 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  53.47 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  51.9 
 
 		 170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  52.08 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  56.74 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  50.63 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  57.24 
 
 		 168 aa  157  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  52 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  53.1 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  50.67 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  57.33 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  53.96 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  52.82 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  52.32 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  46.75 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  51.08 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  42.66 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  46.85 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  44.93 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  46.46 
 
 		 149 aa  117  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  46.46 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  41.61 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  42.07 
 
 		 210 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  42.28 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  47.79 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  38.04 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  43.33 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  41.33 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  43.15 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0894  phosphatidylglycerophosphatase A  48.97 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0879413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  46.38 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  39.61 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  40.76 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  40 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  39.61 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>