173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2282 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 207 aa  416  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  66.67 
 
 		 192 aa  245  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  66.67 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  42.76 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  41.86 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  42.18 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  38.86 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  40.99 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  39.74 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  41.88 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  42.14 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  45.7 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  40.25 
 
 		 164 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  43.05 
 
 		 167 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  41.61 
 
 		 164 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.25 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  40.67 
 
 		 157 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  40.94 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.94 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  44.22 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.29 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  39.86 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  34.24 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.19 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  38.31 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  43.24 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  40.67 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  38.62 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  37.41 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  35.8 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  35.8 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 		 160 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 		 164 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  38.19 
 
 		 164 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  37.75 
 
 		 159 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 		 170 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.3 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 		 168 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  34.36 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 166 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  35.5 
 
 		 168 aa  91.7  6e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 166 aa  92  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 		 168 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 168 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 168 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 168 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  36.65 
 
 		 157 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 		 150 aa  89.7  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  36.05 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  34.72 
 
 		 168 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  31.69 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  31.05 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  31.05 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  31.05 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  31.05 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  31.05 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  29.57 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  34.75 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  34.23 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  34.23 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  37.32 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  29.9 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0894  phosphatidylglycerophosphatase A  40.43 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0879413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  31.71 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0344  phosphatidylglycerophosphatase A  39.22 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  36.31 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>