174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0641 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 157 aa  307  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  60.93 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  58.9 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  50.68 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2588  phosphatidylglycerophosphatase A  60.29 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  48.39 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  42.07 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  42.65 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  35.92 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  36.77 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  44.37 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  36.65 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  37.16 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  37.97 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  37.84 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  36.49 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  38 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  43.36 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  43.88 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  33.99 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.81 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  43.48 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 		 181 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  39.57 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  33.73 
 
 		 192 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  35.71 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  38.41 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  35.17 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40.58 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  35.85 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  35.07 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  43.45 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  36.94 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.41 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  35.58 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  35.95 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  35.95 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  38.85 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  38.56 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  35.26 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  38.57 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  36.31 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  40.54 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  37.01 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  39.44 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  39.71 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  37.58 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  36.49 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  38.67 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  38.67 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  36.49 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  35.95 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  38.81 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  34.31 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  36.65 
 
 		 210 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  37.91 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  38.85 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  37.25 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  39.01 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  37.34 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  42.36 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>