173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2588 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2588  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
174 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  62.91 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  57.89 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  55.41 
 
 
162 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  56.29 
 
 
156 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  51.01 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  41.91 
 
 
161 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  41.91 
 
 
161 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  41.91 
 
 
161 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.99 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  43.06 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  43.88 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  43.38 
 
 
166 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  43.38 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  43.38 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  40.44 
 
 
181 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  38.97 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  37.89 
 
 
183 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  39.13 
 
 
162 aa  84  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  84  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  39.24 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  45.32 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  41.18 
 
 
181 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  44.27 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  39.57 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 
154 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  38.69 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  39.29 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  38.93 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  40.44 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  40.44 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  40.28 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  39.85 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  42 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  43.66 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  39.58 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.96 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  36.3 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  40.43 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  40.43 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  40.43 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  37.89 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  40.88 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  39.55 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  42 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  40.25 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  42.14 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  40.16 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  40.71 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  43.84 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  41.54 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  32.88 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  35.4 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  41.33 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  36.21 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.69 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  39.01 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  36.21 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  37.88 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  36.2 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  41.61 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  42.76 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  36.2 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  34.97 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>