172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0176 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  44.87 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  44.44 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  42.57 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  42.95 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  42.95 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  42.95 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  42.95 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  42.31 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  40.51 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  47.71 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  48.65 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  40.54 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  41.03 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  40.49 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  39.24 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.52 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  40.88 
 
 		 181 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  42.31 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  44.06 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  43.36 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  43.04 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  42.41 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  41.14 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  41.89 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  38.93 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  39.24 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  40.65 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  35.9 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  38.36 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  40.37 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  34.38 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  39.22 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  36.91 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  40.28 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.51 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  36.25 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.22 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  34.55 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  37.2 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  34.19 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  37.93 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  33.54 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  41.5 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  34.62 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  32.69 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  35.81 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  32.69 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  34.38 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  36.02 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  36.02 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  30.34 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  35.62 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  35.62 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  34.57 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  31.14 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3920  phosphatidylglycerophosphatase A  37.72 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0484  phosphatidylglycerophosphatase A  36.09 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  38.71 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  34.44 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  38.67 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.67 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0211  phosphatidylglycerophosphatase  38.01 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.627507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  32.9 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>