155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3666 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 166 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  46.58 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  51.28 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  50.64 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  50.93 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  46.58 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  39.38 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  38.75 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  47.06 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.75 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  36.6 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  36.25 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  36.94 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  37.82 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  39.24 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  35.67 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  32.28 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  41.1 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  34.62 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  38.78 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  35.76 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  39.07 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  34.69 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  37.09 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  37.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  35.03 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  35.03 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  34.62 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  39.44 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  34.39 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  36.99 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  35.44 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  37.8 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  38.73 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  34.39 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  36.91 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  36.36 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  36.67 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  32.08 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  36 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  30.43 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  38.31 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  34.48 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  35.53 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  34.46 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  34.46 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  34.46 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  36.88 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  35.21 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  35.17 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1523  phosphatidylglycerophosphatase A  34.57 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.33575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  32.43 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  31.48 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  32.65 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  33.76 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  33.8 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  31.41 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  36.69 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  41.38 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  34.9 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  33.12 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  34.25 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  40.48 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3640  phosphatidylglycerophosphatase A  32.61 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  32.19 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0442  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.918797  hitchhiker  0.000026138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  39.04 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  32.9 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  33.77 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  35.97 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  33.77 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>