174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2413 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
159 aa  309  9e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  60.93 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  55.26 
 
 
156 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  53.55 
 
 
162 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  57.43 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2588  phosphatidylglycerophosphatase A  63.64 
 
 
174 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  44.52 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.89 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.19 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
168 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  30.82 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  36.69 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.13 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3640  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
171 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  37.23 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  39.38 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  34.81 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  37.8 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  36.96 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  38.69 
 
 
164 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  37.88 
 
 
183 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
181 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  37.76 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  43.7 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.64 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  40.31 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  41.61 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  37.96 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  43.66 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  41.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  40.31 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  37.88 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  37.88 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.78 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  37.78 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  37.98 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  39.53 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  33.81 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  36.43 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.26 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  38.76 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  38.76 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  40.8 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  41.35 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  37.59 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  39.39 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  36.55 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  37.04 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  35.77 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  37.04 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  36.23 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  37.68 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  37.16 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  37.4 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  30.6 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  35.88 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  41.18 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  38.36 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  41.13 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  42.15 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  41.94 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>