174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0560 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
162 aa  316  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  53.55 
 
 
159 aa  151  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  50.68 
 
 
157 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  52.63 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  53.19 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2588  phosphatidylglycerophosphatase A  57.04 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  45.45 
 
 
167 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  45.39 
 
 
177 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  45.39 
 
 
167 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  44.76 
 
 
167 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  44.76 
 
 
167 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  44.76 
 
 
167 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  44.52 
 
 
163 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  46.21 
 
 
159 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  42.55 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  42.55 
 
 
171 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  46.38 
 
 
158 aa  94.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  43.97 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  42.65 
 
 
145 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  38.62 
 
 
162 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.01 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  36.88 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.72 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  38.06 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  39.86 
 
 
181 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  40.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  40.43 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  37.41 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
180 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  31.29 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  42.75 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  39.85 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  39.72 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  41.78 
 
 
154 aa  84  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  37.59 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  41.3 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  41.84 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  43.8 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  34.69 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  34.59 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  40.41 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  38.58 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  39.39 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  38.36 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  39.72 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  40.77 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  38.57 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  36.88 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  43.23 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  39.1 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  37.67 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  41.73 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  33.13 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.56 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  33.83 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  31.87 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  35.92 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  34.78 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  35.07 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  34.68 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  39.72 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  33.54 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  32.32 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  31.37 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  36.02 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  34.69 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  34.42 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  35.4 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  34.15 
 
 
213 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  36.05 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  40.56 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>