174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3133 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 166 aa  319  9.000000000000001e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  44.53 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  42.96 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  41.83 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  40.67 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  38.36 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  37.13 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  39.31 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  39.47 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  39.47 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40.54 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  38.61 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  38.61 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  42.36 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  39.46 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  43.15 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  34.39 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  39.73 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  38.36 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.54 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  41.57 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  38.85 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  40.77 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  40.38 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  37.97 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  38.99 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  38.1 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  40.82 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  36.18 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  40.38 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  40.82 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  43.85 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  38.06 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  36.54 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  44.37 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  39.76 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  40.14 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  41.91 
 
 		 210 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  40.26 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  42.07 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  40.54 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  38.82 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  34.29 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  43.36 
 
 		 193 aa  84  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  39.58 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  41.96 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  40.26 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  38.27 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  40.91 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>