171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1365 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 
165 aa  321  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  60.87 
 
 
162 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  51.55 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  48.17 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  47.56 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  49.67 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  46.58 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  32.03 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  41.42 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  34.38 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  36.94 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  33.99 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  34.36 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  32.86 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  30.71 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  37.34 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  37.91 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  33.97 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  34.69 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.33 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  39.46 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  36 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  34.51 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  39.19 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  36.08 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  34.07 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  30.19 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  41.3 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  39.22 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  33.82 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  32.21 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.33 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  39.55 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  35.03 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  38.41 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  37.25 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  36.77 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  38.52 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  34.21 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  32.05 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  31.29 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  34.35 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  37.24 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  34.48 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  37.78 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  37.58 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  36.17 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  35.67 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  36.49 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  35.62 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  34.97 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  33.11 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  39.1 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  35.51 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  36.36 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  30.49 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  37.88 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  39.44 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  32.88 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  34.18 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  35 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>