173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1910 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
160 aa  296  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  47.71 
 
 
159 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  44 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  40.41 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  41.96 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  37.82 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  30.82 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  40.94 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  37.84 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  36.91 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  40.69 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  38.96 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  37.14 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  41.61 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  35.48 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  37.58 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  34.16 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  37.68 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  36.84 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  36.71 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  40.41 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  34.67 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  35.98 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  32.88 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  39.04 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  37.09 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.41 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  35.71 
 
 
175 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  32.88 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  37.67 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  33.11 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  38.3 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  37.24 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  38.17 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  37.76 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  36.11 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  36.29 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  38.73 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  36.55 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  35.9 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  32.68 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  39.44 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  39.04 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  40.67 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  37.76 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.19 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  35.34 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  30.54 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  38.57 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  38 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  38.13 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  37.09 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  37.31 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.36 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.67 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  40.77 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  38.3 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  38.51 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  39.6 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  32.19 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  40.67 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  39.6 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  39.6 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  34 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  38.93 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  35.17 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>