173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1582 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
160 aa  307  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  57.43 
 
 
159 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  52.63 
 
 
162 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  56.94 
 
 
156 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  48.39 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2588  phosphatidylglycerophosphatase A  52.27 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  44.7 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  42.03 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  32.34 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  37.2 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  41.67 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3640  phosphatidylglycerophosphatase A  38.78 
 
 
171 aa  87.8  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 
167 aa  87.4  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  32.85 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  41.56 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  44 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
167 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  39.57 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  39.57 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  41.72 
 
 
163 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 
154 aa  84  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  39.35 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  42.4 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  39.31 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.88 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  41.56 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.46 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.61 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.13 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.61 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.61 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  40.3 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  38.64 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  39.55 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  35.71 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  37.59 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  35.97 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  40.69 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  35.46 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  41.35 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  40.6 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  44.35 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  34.46 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  37.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  37.16 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  35.77 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  38.4 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.25 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  36.64 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  35.04 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  36.64 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  38.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  34.68 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  36.65 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  37.4 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  35.07 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  37.41 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  34.13 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  36.57 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  46.67 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  45.39 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.58 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  36.15 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  35.04 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  30.41 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  34.78 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>