174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3452 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 159 aa  318  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  58.5 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  58.04 
 
 		 157 aa  170  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  56.77 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  56.86 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  55.06 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  52.74 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  55.33 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  56.16 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  56.16 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  56.16 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  58.27 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  52.44 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  51.37 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  54.67 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  57.55 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  55.78 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  54.67 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  54.67 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  52.53 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  52.53 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  55.1 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  55.1 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  54.42 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  51.61 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  54 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  55 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  54.29 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  52 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  55 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  55 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  57.86 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  51.32 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  51.63 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  51.63 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  51.05 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  53.69 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  55.1 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  52.29 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  52.29 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  54.36 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  52.38 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  51.37 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  53.9 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  54 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  50.99 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  49.68 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  51.05 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  48.97 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  54.55 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  52.11 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  49.09 
 
 		 180 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  52.82 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  52.82 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  46.1 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  48.3 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  45.21 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  44.52 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  43.57 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  43.62 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  41.51 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  40.28 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  43.51 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  40.74 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 181 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 		 192 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  40.65 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  40.69 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  43.17 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  41.29 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  38.19 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  38.19 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  39.58 
 
 		 183 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  40.28 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  40.85 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 210 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>