175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1265 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
154 aa  295  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  42.21 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  41.1 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  41.1 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  42.96 
 
 
164 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  41.73 
 
 
164 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  40.29 
 
 
164 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  42.25 
 
 
161 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  42.25 
 
 
161 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  42.25 
 
 
161 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  41.01 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  43.06 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  41.01 
 
 
166 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  41.01 
 
 
164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  42.36 
 
 
164 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  43.06 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  43.75 
 
 
165 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  41.22 
 
 
164 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  37.11 
 
 
160 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  39.07 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  44.83 
 
 
167 aa  97.4  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  39.72 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  39.57 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  38.57 
 
 
163 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  39.46 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  42.75 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  39.85 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  40.71 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  41.06 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
149 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 
168 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  35.66 
 
 
150 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 
178 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  41.48 
 
 
168 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  39.19 
 
 
164 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  40.54 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  40.26 
 
 
180 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
168 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
169 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  37.75 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  43.88 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  38.73 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  42.34 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  38.85 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  37.23 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 
167 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  41.3 
 
 
167 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  39.31 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  43.07 
 
 
161 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.71 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  40.14 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.62 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 
159 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  38.22 
 
 
175 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  35.77 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  37.68 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  30.57 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  30.57 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  39.58 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  40.15 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  39.35 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  36.23 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  39.42 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  37.93 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  35.21 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  36.43 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  35.62 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  41.86 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  37.24 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  39.55 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  39.55 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  39.39 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  41.09 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  41.09 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>