168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2401 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1523  phosphatidylglycerophosphatase A  54.61 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.33575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  43.36 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  34.9 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  36.23 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  36.18 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  36.3 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  37.86 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  37.84 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  50 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  34.48 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  42.67 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  40.79 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  34.78 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  40.79 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  40.79 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  40.79 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  38.04 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  34.27 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  35.25 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  37.41 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  34.78 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  34.29 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0442  phosphatidylglycerophosphatase A  34.38 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.918797  hitchhiker  0.000026138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  46.43 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.2 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  42.31 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  42.31 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  42.67 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  38.31 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  34.29 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  38.61 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  41.33 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  34.27 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  45.33 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  41.03 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  44.83 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  35.53 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  39 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  36.63 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  34.03 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  40.22 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  41.77 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  36.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  37.62 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  42.11 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  41.25 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  37.93 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.02 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  46.38 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  35.29 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  46.38 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  34.87 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  46.38 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  34.21 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  47.3 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  38.71 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  40.96 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  30.41 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  32.65 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  36.84 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  44.3 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  40.2 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  31.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  40.48 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  40.48 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  40.48 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  40.48 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  39.29 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  31.17 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>