169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0405 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  69.13 
 
 
155 aa  197  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  61.18 
 
 
166 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  63.76 
 
 
155 aa  178  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  60.53 
 
 
166 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  60.53 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  56.58 
 
 
171 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  59.73 
 
 
163 aa  158  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  51.09 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  43.29 
 
 
168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  40.77 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  36.6 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  36.17 
 
 
207 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  36.3 
 
 
177 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  36.89 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
171 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
171 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  35.66 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  34.03 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  38.28 
 
 
164 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  35.16 
 
 
161 aa  83.6  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  35.95 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  34.59 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  37.96 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  35.95 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  32.67 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  38.24 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  41.22 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  36.23 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  38.28 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  40.69 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.06 
 
 
164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
164 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  36.62 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  35.92 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  32.33 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  34.09 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  34.78 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  35.56 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  35.14 
 
 
192 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  34.03 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  34.29 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  38.46 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  35.16 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  35.94 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  34.64 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  35.92 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  32.26 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  32.82 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  36.43 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  32.8 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  32.45 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  34.88 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  33.85 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  34.62 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  32 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  32.8 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  34.07 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  31.15 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  31.15 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  32.19 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>