136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1461 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
165 aa  321  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  98.18 
 
 
165 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  85.45 
 
 
165 aa  240  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  53.99 
 
 
161 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  48.17 
 
 
165 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  51.2 
 
 
162 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  49.09 
 
 
166 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  37.04 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  37.59 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  40.69 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  37.33 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  43.71 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  36.71 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  36.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  41.29 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  31.1 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  36.31 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  31.29 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  38.31 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  37.25 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  32.69 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  39.51 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  31.33 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  37.75 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  35.22 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  32.3 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  35.76 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  37.91 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  35.15 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  33.99 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  37.82 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  31.79 
 
 
149 aa  60.8  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  32.24 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  34.59 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  35.54 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  35.25 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  36.18 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.46 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  36.49 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  39.29 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  34.53 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  31.58 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  32.46 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  37.16 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  35.1 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  34.21 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  35.1 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  35.1 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  31.21 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  34.44 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  34.03 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  38.03 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  28 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  33.81 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  31.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  34.03 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  37.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  30.61 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  37.09 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  32.24 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  32.86 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  33.1 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  35.53 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  34.87 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  34.04 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.71 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  36.05 
 
 
159 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  32.41 
 
 
178 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  31.03 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  33.09 
 
 
195 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  33.09 
 
 
195 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  31.03 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  34.29 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  31.97 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  32.64 
 
 
210 aa  51.2  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  31.03 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>