172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1730 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  65.36 
 
 
158 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  59.24 
 
 
163 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  62.94 
 
 
164 aa  160  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  53.16 
 
 
167 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  52.63 
 
 
152 aa  154  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  50.64 
 
 
158 aa  151  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  37.42 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  43.97 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  40.44 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  41.42 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  38.62 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  34.62 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1523  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.33575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  38.89 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  37.86 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  38.67 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  37.82 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  36.62 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  38.78 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  36.62 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  38.35 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  42.25 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  37.84 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  40 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  38.03 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  34.9 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  37.12 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  37.86 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  36.69 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  36.49 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  36.43 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  33.57 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  33.97 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  35.57 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  39.26 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  41.06 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  33.57 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  37.12 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  38.16 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  35.56 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  31.54 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.78 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  35.86 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  37.04 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  37.68 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  36.43 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  34.04 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  36.23 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  36.43 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  35.92 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  35 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  34.56 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  36.9 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  37.32 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  35.92 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  37.14 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  32.86 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  35.66 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  36.51 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  35.37 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  37.86 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  41.67 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  35.43 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.96 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>