169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3401 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  93.78 
 
 		 193 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  75 
 
 		 213 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  64.5 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  64.5 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  64.5 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  64.5 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  64.5 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  66.29 
 
 		 182 aa  237  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  68.79 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  70.55 
 
 		 183 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  72.85 
 
 		 157 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  70.25 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  69.62 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  68.55 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  69.62 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  67.3 
 
 		 181 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  72.48 
 
 		 154 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  60.74 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  54.1 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  53.55 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  58.75 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  57.5 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  58.75 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0211  phosphatidylglycerophosphatase  52.6 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.627507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0484  phosphatidylglycerophosphatase A  51.74 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  52.81 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0582  phosphatidylglycerophosphatase A  47.67 
 
 		 175 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0709  phosphatidylglycerophosphatase A  53.12 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  48.86 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0430  phosphatidylglycerophosphatase  51.28 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0355  phosphatidylglycerophosphatase  51.25 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0344  phosphatidylglycerophosphatase A  51.25 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3920  phosphatidylglycerophosphatase A  48.26 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  50.34 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3741  phosphatidylglycerophosphatase  50.99 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0222  phosphatidylglycerophosphatase A  45.61 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0244  phosphatidylglycerophosphatase A  42.13 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  41.24 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  44.3 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  40 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  40.26 
 
 		 162 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  42.24 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  44.22 
 
 		 167 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  41.56 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  41.06 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  43.4 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  40.4 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  44.81 
 
 		 163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  43.66 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  37.27 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  40.76 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  40.83 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  40.97 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  40.25 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  41.29 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40.4 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  38.03 
 
 		 160 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  38.41 
 
 		 164 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  48.23 
 
 		 159 aa  104  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  38.27 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  39.88 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  38.96 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  38.22 
 
 		 164 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  36.81 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  42.04 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  37.01 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.38 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  42.28 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  40.13 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  38.56 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  37.82 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  39.74 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  36.67 
 
 		 170 aa  98.2  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  36.97 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  36.71 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  36.71 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>