171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1869 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1869  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  44.53 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  44.03 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  38.89 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  38.89 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  41.33 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  42 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  42.34 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  43.07 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  40.13 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  38.19 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  41.61 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  40.62 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  43.84 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  40.14 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  36.99 
 
 		 162 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  40.13 
 
 		 159 aa  91.3  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  40.41 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  38.97 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  40.79 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  35.71 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  41.22 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  39.86 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  40.27 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  36.99 
 
 		 157 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 		 164 aa  87.8  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  41.18 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  38.13 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  37.41 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  39.73 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  36.84 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  38.18 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  38.13 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  39.73 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  39.61 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  37.09 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  40.56 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  39.47 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  38.31 
 
 		 167 aa  85.1  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  33.53 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  38.24 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  36.84 
 
 		 160 aa  84.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  37.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  36.88 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  48.82 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  41.26 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  38.96 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  40.56 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  41.45 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  37.14 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  39.01 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  38.3 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  34.93 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  39.23 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  41.55 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  38.93 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  36.76 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  39.71 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  38 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  38 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  38.35 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  37.21 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  42.07 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  39.22 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  31.54 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  32.61 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  37.23 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  38.57 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  35.46 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  33.58 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  35.03 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  38.36 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  32.93 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  35.56 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>