174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1678 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  63.16 
 
 		 164 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  51.3 
 
 		 164 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  53.59 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  54.97 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  52.94 
 
 		 164 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  52.98 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  52.6 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  52.6 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  53.79 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  52.41 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  51.72 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  48.94 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  51.68 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  52.94 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  48.08 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  52.11 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  48.97 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  45.78 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  49.02 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  45.7 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  46.67 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  46.1 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  43.9 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  45.45 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  47.79 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  43.9 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  43.9 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  43.9 
 
 		 167 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  52.6 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  50.72 
 
 		 174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  43.67 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  43.62 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  43.62 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  43.62 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  46.26 
 
 		 163 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  43.04 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  41.46 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  43.04 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  45.77 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  45.75 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  46.15 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  43.87 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  42.86 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  44.08 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  45.1 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  41.14 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  44.08 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  43.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  43.92 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  38.86 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  43.62 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  40.26 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  43.97 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  43.42 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  42.76 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  43.45 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  43.06 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  47.76 
 
 		 145 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  39.77 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  47.48 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  37.57 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  42.67 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  43.66 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  43.66 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  38.51 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  37.93 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  37.93 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  40.14 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  41.14 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  40.51 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  36.11 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  41.3 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  38.27 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  43.31 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  38.75 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2849  phosphatidylglycerophosphatase  38.29 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  46.27 
 
 		 149 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  41.73 
 
 		 149 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  40.97 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  41.89 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  39.44 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  40.28 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>