174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1855 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  72.46 
 
 
167 aa  255  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  67.66 
 
 
168 aa  246  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  70.06 
 
 
167 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  58.9 
 
 
161 aa  205  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  58.9 
 
 
161 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  58.9 
 
 
161 aa  205  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  58.02 
 
 
164 aa  204  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  60.76 
 
 
168 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  60.13 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  60.13 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  60.13 
 
 
168 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  59.49 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  54.43 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  55.15 
 
 
164 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2895  phosphatidylglycerophosphatase A  58.67 
 
 
168 aa  175  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  58.06 
 
 
164 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  52.83 
 
 
163 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  52.12 
 
 
164 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3086  phosphatidylglycerophosphatase A  51.88 
 
 
170 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  60.25 
 
 
164 aa  167  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  51.23 
 
 
164 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  51.32 
 
 
157 aa  164  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  55.49 
 
 
162 aa  164  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  56.95 
 
 
160 aa  164  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  56.33 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  54.19 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  54.19 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  53.7 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  54.19 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  50.33 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  58.13 
 
 
164 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  55.62 
 
 
159 aa  160  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  52.44 
 
 
159 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  56.6 
 
 
164 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  56.88 
 
 
164 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  58.06 
 
 
166 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  54.32 
 
 
165 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  53.33 
 
 
157 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  48.67 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  47.33 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  47.33 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  47.33 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  46 
 
 
167 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  48.1 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  48.1 
 
 
171 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  50.32 
 
 
174 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  46.5 
 
 
159 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  46.67 
 
 
177 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  47.74 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  43.83 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  48.5 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  48.5 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  46.88 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  41.51 
 
 
168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  43.24 
 
 
160 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  42.86 
 
 
181 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  41.89 
 
 
160 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  47.3 
 
 
180 aa  121  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  41.88 
 
 
207 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  42.21 
 
 
193 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  43.26 
 
 
213 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  39.75 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  41.56 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0915  phosphatidylglycerophosphatase A  42.38 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000968803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  41.43 
 
 
145 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  42.28 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4475  phosphatidylglycerophosphatase  39.31 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  43.33 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  39.57 
 
 
149 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  44.29 
 
 
183 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
160 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0077  phosphatidylglycerophosphatase A  40.46 
 
 
193 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3015  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 
192 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2605  phosphatidylglycerophosphatase A  39.87 
 
 
191 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280731  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2769  phosphatidyl-glycerophosphatase hydrolase transmembrane protein  37.58 
 
 
174 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135706  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  44.87 
 
 
159 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  40.38 
 
 
181 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  40.85 
 
 
183 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  38.1 
 
 
210 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2194  phosphatidylglycerophosphatase  43.45 
 
 
159 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000299567  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  38.85 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  39.33 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  39.62 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  38.13 
 
 
149 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  39.74 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  40.91 
 
 
181 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  42.96 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  42.96 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>