174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1687 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  64.74 
 
 
158 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  53.16 
 
 
158 aa  156  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  49.4 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  54.55 
 
 
158 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  50 
 
 
152 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  49.65 
 
 
164 aa  124  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  41.35 
 
 
149 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  36.25 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  36.13 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  37.4 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  42.36 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  38.04 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  38.12 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  39.85 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  38.12 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1523  phosphatidylglycerophosphatase A  38.67 
 
 
158 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.33575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  35.76 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  38.13 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  35.22 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  45.56 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  40.29 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  35.14 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  36.72 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  35.03 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  34.93 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  35.03 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  32.67 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  36.3 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  34.42 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  41.67 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  36.57 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  34.78 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  34.34 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  36.62 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  33.55 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  36.3 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  36.02 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  37.5 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  34.33 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  36.91 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  39.26 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  37.91 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  33.99 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  34.81 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  34.57 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  36.91 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  36.62 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  35.14 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  32.64 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  36.25 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  34.04 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  35.77 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  36.29 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2321  phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins-like  34.04 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  33.54 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  30.77 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  37.01 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  35.4 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  36.81 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  33.77 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  40.28 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  37.16 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  30.87 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  30.87 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2772  phosphatidylglycerophosphatase  34.9 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0288335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  33.72 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  35.82 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  30.2 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  37.9 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  37.14 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  34.13 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  37.1 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  34.92 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  37.14 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1150  phosphatidylglycerophosphatase  43.59 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.313843  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  30 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  37.59 
 
 
213 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  34.93 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  34.06 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  31.43 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  37.1 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  36.88 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  37.1 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>