162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2321 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2321  phosphatidylglycerophosphatase A and related proteins-like  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0142  phosphatidylglycerophosphatase A  40.52 
 
 
145 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0216  phosphatidylglycerophosphatase A  37.09 
 
 
149 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2402  phosphatidylglycerophosphatase  40.25 
 
 
150 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3627  phosphatidylglycerophosphatase A  39.86 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3732  phosphatidylglycerophosphatase A  39.16 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  34.04 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0195  phosphatidylglycerophosphatase  33.99 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154133  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  35.17 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1534  phosphatidylglycerophosphatase A  37.41 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0603725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  36.77 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  30.3 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3682  phosphatidylglycerophosphatase A  37.4 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3751  phosphatidylglycerophosphatase A  37.4 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3452  phosphatidylglycerophosphatase  32.24 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3613  phosphatidylglycerophosphatase  36.64 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  35.71 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0555  phosphatidylglycerophosphatase  36.42 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  34.84 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  35.29 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  34.64 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1217  phosphatidylglycerophosphatase A  33.11 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00160129  normal  0.251899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  35.81 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0390  phosphatidylglycerophosphatase  42.68 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  31.85 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  32.12 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.5 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.044586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2756  phosphatidylglycerophosphatase A  31.64 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.617672  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  38.69 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  32.41 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  32.89 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2479  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  31.91 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3476  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.851848  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3401  phosphatidylglycerophosphatase A  36.36 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394477  normal  0.0499313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1187  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  31.21 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  33.99 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  32.62 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  32.65 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0398  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.132793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1258  putative phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3441  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3478  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3307  phosphatidylglycerophosphatase A  31.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  30.5 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1652  phosphatidylglycerophosphatase A  34.93 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  29.68 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  33.11 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1855  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.020025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  32 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3297  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162113  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  41.49 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  31.48 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3154  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000760341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3152  phosphatidylglycerophosphatase A  31.97 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  36.84 
 
 
160 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  32.65 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1388  phosphatidylglycerophosphatase A  33.09 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1565  phosphatidylglycerophosphatase A  45.68 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  31.68 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  36.36 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0491  phosphatidylglycerophosphatase  34.25 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.926043  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  33.11 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  34.23 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  34.46 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  31.58 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  32.69 
 
 
154 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  34.29 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  31.58 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  31.68 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  32.41 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0713  phosphatidylglycerophosphatase A  33.57 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1048  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0102464 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1168  phosphatidylglycerophosphatase  34.31 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0929  phosphatidylglycerophosphatase A  30.14 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  32.87 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  31.08 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0480  phosphatidylglycerophosphatase A  31.76 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3048  phosphatidylglycerophosphatase  31.79 
 
 
190 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4046  phosphatidylglycerophosphatase A  30.94 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  31.65 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  33.09 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  31.79 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  31.13 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0459  phosphatidylglycerophosphatase A  31.08 
 
 
168 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1041  phosphatidylglycerophosphatase  33.79 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00761456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0522  phosphatidylglycerophosphatase A  31.08 
 
 
168 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  31.76 
 
 
168 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3640  phosphatidylglycerophosphatase A  35.56 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  29.8 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  31.79 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>