More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2086 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2086  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  70.13 
 
 		 80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  48.57 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  43.42 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  46.97 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  46.77 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  43.24 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  45.07 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  44.59 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  45.76 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  41.43 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  48.33 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  44.07 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  49.15 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  49.15 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  46.03 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  44.44 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  45 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  66.6  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  46.15 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  42.62 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  41.43 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  37.68 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  47.69 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  46.55 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  45.16 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  42.65 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  40.58 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  42.37 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  41.1 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  43.48 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4430  hypothetical protein  37.68 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  40.58 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  40.3 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  41.54 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  39.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  46.03 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  39.44 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  43.28 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.46 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  46.03 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  38.67 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  47.46 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  44.62 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  40.98 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  36.76 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  40.32 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  41.43 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  47.46 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  47.46 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  38.1 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  39.39 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9606  predicted protein  38.81 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  45.76 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  38.57 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  45.76 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  36.76 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  35.29 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  38.24 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  43.86 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  40.91 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  42.42 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  38.1 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  33.82 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>