More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_38040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  100 
 
 
100 aa  203  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
115 aa  103  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 
124 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  70.15 
 
 
105 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  64.38 
 
 
76 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  64.38 
 
 
76 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
107 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  63.38 
 
 
74 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  64.38 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 
113 aa  90.1  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  65.15 
 
 
98 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  69.12 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  56.45 
 
 
68 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.1 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  56.76 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  51.67 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  46.38 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  58.97 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  58.44 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  54.43 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  52.05 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 
89 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  41.98 
 
 
85 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  41.98 
 
 
85 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  53.73 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.68 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  43.48 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  63.93 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.68 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  60.32 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  62.3 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  60 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  46.25 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.94 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  57.81 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  56.52 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  55.56 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.47 
 
 
206 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  47.89 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  44.44 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  52.5 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.86 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.41 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  49.25 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  56.52 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  53.97 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  48.44 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  51.52 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.83 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  49.38 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.16 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  45.71 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  49.4 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  53.85 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  51.39 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  44.93 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  57.14 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  45.83 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  47.54 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  47.54 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.17 
 
 
84 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>