More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3214 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  62.32 
 
 
74 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  61.54 
 
 
81 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
85 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  59.09 
 
 
82 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  58.46 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  60.87 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
75 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  62.12 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  60.56 
 
 
71 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  60.87 
 
 
93 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  54.55 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  56.67 
 
 
70 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
68 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
83 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.97 
 
 
76 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
71 aa  87  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  56.06 
 
 
77 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  62.12 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  59.65 
 
 
73 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  55.07 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  59.38 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  57.58 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  55.38 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.55 
 
 
97 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  55.38 
 
 
79 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.52 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  49.25 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  62.3 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  55.38 
 
 
71 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  55.07 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  56.52 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
70 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  50.77 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  48.48 
 
 
90 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  55.07 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  64.81 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  58.46 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  46.97 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  46.97 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  51.47 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  52.31 
 
 
71 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  52.31 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  46.38 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.72 
 
 
77 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  59.38 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  53.62 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  55.38 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  46.38 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  43.28 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  48.48 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  49.28 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  54.69 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  52.38 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>