More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2398 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  149  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  63.01 
 
 
136 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  67.21 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  61.43 
 
 
83 aa  87.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  61.11 
 
 
69 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  61.11 
 
 
69 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  57.53 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  59.65 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  57.53 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.16 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  58.33 
 
 
68 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
70 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  53.42 
 
 
76 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.78 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
69 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  57.14 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  50.68 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.79 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.05 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  54.79 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.58 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.05 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  54.55 
 
 
214 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  58.62 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  52.05 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  52.05 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  53.42 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  54.55 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  52.05 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  57.14 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2933  protein of unknown function DUF37  61.4 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000803999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  43.06 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  61.11 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  50.68 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.02 
 
 
77 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  45.21 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
80 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  53.23 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  52.17 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  46.97 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  60.66 
 
 
71 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  55.74 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  46.58 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  48.57 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9606  predicted protein  47.76 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  43.06 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.77 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  46.58 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.85 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  49.25 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  47.69 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.45 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.1 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  47.95 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  44.29 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.1 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  56.14 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.1 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  56.06 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>