More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4223 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  60 
 
 
100 aa  103  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  60.53 
 
 
124 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  54.88 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  55.06 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  53.42 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  49.47 
 
 
99 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  60.81 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  61.04 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50.59 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  43.68 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  63.08 
 
 
74 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  59.7 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  48.1 
 
 
84 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  45.21 
 
 
79 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.15 
 
 
105 aa  87  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  45 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  50.7 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  52.11 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  47.95 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  46.25 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  53.73 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  84.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 
74 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  48.05 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  46.75 
 
 
85 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
130 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  56.52 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50.67 
 
 
96 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2556  protein of unknown function DUF37  57.81 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000722827  normal  0.286843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  53.12 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  53.03 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  52.05 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  49.28 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.72 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 
73 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  53.03 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  50.7 
 
 
73 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  53.73 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  44.74 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  43.42 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  43.42 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  43.42 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  43.42 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  53.62 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  50.7 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  46.74 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  39.78 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  43.66 
 
 
72 aa  80.5  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  56.06 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  58.06 
 
 
64 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.06 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  59.02 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  52.05 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4546  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.019004  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.17 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  50.82 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0880  hypothetical protein  44.78 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  47.89 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  58.73 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  46.88 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  53.85 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  44.59 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  49.3 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  41.56 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  56.52 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>