More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2395 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  68.49 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  66.67 
 
 
136 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  66.2 
 
 
81 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  66.2 
 
 
81 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  61.84 
 
 
87 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
85 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  55.13 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  56.58 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  55.13 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  62.32 
 
 
69 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  59.46 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  57.53 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  63.24 
 
 
82 aa  94  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  57.75 
 
 
206 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  53.85 
 
 
97 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  61.11 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  55.13 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0889  protein of unknown function DUF37  65.38 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00411126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  59.42 
 
 
85 aa  92.8  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  59.15 
 
 
74 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  54.93 
 
 
214 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  59.42 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  57.75 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.67 
 
 
84 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.82 
 
 
74 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.17 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  53.01 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  51.9 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  63.77 
 
 
71 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.97 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  62.12 
 
 
70 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.07 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  51.32 
 
 
86 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  67.21 
 
 
73 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.29 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  59.42 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  56.52 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  56.52 
 
 
86 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  59.72 
 
 
75 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  53.52 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  63.93 
 
 
64 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
71 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  54.29 
 
 
88 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  52.11 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  61.29 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  55.56 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  50.62 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  52.63 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  51.85 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  55.07 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  49.35 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  51.39 
 
 
81 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  60.87 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  59.68 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  51.39 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  61.9 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  52.11 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  59.09 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  49.32 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.21 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  59.68 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  56.52 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.17 
 
 
77 aa  84  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  60.66 
 
 
78 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  60.94 
 
 
85 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>