More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2995 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  69.57 
 
 
69 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  62.32 
 
 
70 aa  99.4  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  63.24 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  63.24 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  63.24 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  63.24 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  63.24 
 
 
77 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  61.76 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 
71 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  60.29 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  60.29 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  58.82 
 
 
75 aa  93.2  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  60.29 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  60.29 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  60.29 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  60.29 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.41 
 
 
97 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
68 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
75 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  59.42 
 
 
71 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  55.88 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0975  hypothetical protein  62.12 
 
 
69 aa  90.1  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000912323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  56.34 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  57.35 
 
 
86 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
80 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
69 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
97 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  65.22 
 
 
71 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  57.35 
 
 
70 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  58.82 
 
 
72 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  54.41 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  52.24 
 
 
70 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  55.88 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  61.11 
 
 
73 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  58.82 
 
 
81 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
70 aa  87.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
92 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  55.88 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  54.41 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.82 
 
 
74 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  46.27 
 
 
74 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.88 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
83 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  46.97 
 
 
115 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.35 
 
 
86 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  52.94 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  57.14 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.88 
 
 
99 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  57.35 
 
 
81 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  52.94 
 
 
70 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 
94 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.35 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  58.62 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  58.73 
 
 
64 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  52.94 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  52.31 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  52.94 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  45.45 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  42.65 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  54.41 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  47.06 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  47.06 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.55 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  54.41 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  68.52 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>