More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1234 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  201  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  56.32 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  59.74 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  55 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.14 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  56.52 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  53.62 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  52.86 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  53.62 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.86 
 
 		 78 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  47.44 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  51.35 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  48.57 
 
 		 74 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  48.57 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 76 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 76 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.88 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.88 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  55.71 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.73 
 
 		 214 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  52.24 
 
 		 206 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  47.83 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.83 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  50.72 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.07 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  48.57 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.1 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  52.17 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  46.38 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  49.28 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  46.58 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.14 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  47.83 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  51.43 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.44 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  46.97 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  43.24 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  45.71 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6898  protein of unknown function DUF37  44.29 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  40.96 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  46.38 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.74 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  43.28 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  52.05 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  45.71 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  45.71 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  53.73 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  50.72 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  43.84 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>