More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2667 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  55.1 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  55.1 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  57.14 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  55.68 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  60.53 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  57.3 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  53.41 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  57.65 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  51.69 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  61.97 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  61.25 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  57.65 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  50.56 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  57.83 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  44.86 
 
 		 214 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  53.52 
 
 		 79 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  47.42 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  53.52 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  50.53 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  62.9 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  58.33 
 
 		 80 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  48.89 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  51.14 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  55.42 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.25 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  46 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.76 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  59.68 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.76 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  50.68 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  52.17 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  58.06 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  52.05 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50.67 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.33 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  51.35 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  51.81 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  52.86 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  55.71 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  57.38 
 
 		 97 aa  87.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  46.94 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  55.84 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  48.91 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.42 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.45 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  57.35 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  53.52 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  53.52 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  48 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.25 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  50.62 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  55.22 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  47.3 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  54.79 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  59.02 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  52.11 
 
 		 80 aa  84.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  59.68 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  53.52 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  52.86 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  52.78 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  56.25 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  58.73 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  50.7 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.38 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  52.17 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  44.68 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  56.92 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.68 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>