More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1968 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 87 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  68.92 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  61.84 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 70 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  62.5 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  58.9 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  60.81 
 
 		 74 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  57.14 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  52.63 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  58.57 
 
 		 76 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  57.97 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  52.11 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  59.42 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  55.07 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  53.95 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.07 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.67 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  53.25 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  57.14 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  54.43 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  57.97 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  50.68 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  54.17 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  59.42 
 
 		 72 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  64.52 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0889  protein of unknown function DUF37  70.13 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00411126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  63.93 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50.63 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  57.14 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  58.73 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50.63 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  52.05 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  51.39 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.05 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  56.52 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.05 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  52.86 
 
 		 214 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  52.86 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.62 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  47.95 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  55.07 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  49.32 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  49.33 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.03 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  52.05 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  56.06 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  50.75 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  57.38 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  56.58 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  53.23 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2389  hypothetical protein  54.79 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068208  hitchhiker  0.00000056486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2474  hypothetical protein  54.17 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00217526  hitchhiker  0.000573367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5094  protein of unknown function DUF37  62.5 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  45 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  60.66 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  44.59 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  44.59 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.78 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  58.73 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  45.33 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>