More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4698 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  183  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  72.06 
 
 
131 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  61.73 
 
 
130 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  62.82 
 
 
122 aa  103  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  58.02 
 
 
91 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  59.72 
 
 
117 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  54.55 
 
 
85 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  59.42 
 
 
99 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  56 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  57.53 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50.67 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  60.87 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  54.22 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.42 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  51.95 
 
 
85 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  55.41 
 
 
85 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  61.64 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  55.7 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 
87 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  52 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56 
 
 
81 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  49.33 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  49.33 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  49.33 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  51.95 
 
 
85 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.7 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  50.65 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  56 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  52 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  60.87 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  48 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  56.52 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.95 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  55.41 
 
 
123 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  51.76 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  48 
 
 
75 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  53.95 
 
 
101 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  53.85 
 
 
80 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  53.52 
 
 
73 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  60.87 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  61.76 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  52.7 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  53.95 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  57.33 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  56 
 
 
81 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  46.67 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.62 
 
 
214 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  50.65 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  50.65 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  50.65 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  56.34 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  47.62 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  56 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  52.7 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  52.7 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  48.68 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  52.7 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  55.07 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  51.35 
 
 
85 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  53.85 
 
 
115 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
73 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  52.17 
 
 
206 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  59.7 
 
 
105 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  44 
 
 
75 aa  87  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  44 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  44 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  44 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  42.67 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  44 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  58.11 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>