More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1847 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  88.06 
 
 
134 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  63.91 
 
 
128 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  72.73 
 
 
108 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  70.59 
 
 
109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  66.33 
 
 
119 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  66.67 
 
 
123 aa  140  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  66.67 
 
 
123 aa  140  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  140  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  56.63 
 
 
121 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  58.24 
 
 
115 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  58.24 
 
 
105 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  61.9 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  56.32 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  58.24 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  53.19 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  59.52 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  54.95 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.56 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  60.49 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  54.55 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  53.25 
 
 
87 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  49.41 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  48.68 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  51.52 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  50.72 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  50.62 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  50.67 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  43.18 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  54.84 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  52.31 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  54.84 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  53.23 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  48.65 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  47.06 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  47.06 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  44.12 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  44.12 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  49.25 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  49.25 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 
70 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  41.43 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  43.04 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  44.29 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  45.71 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  43.04 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  46.77 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  46.97 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  44.12 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  49.18 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  46.88 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  48.48 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  44.78 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  47.22 
 
 
71 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  41.43 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  44.12 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  48.53 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  41.89 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  41.27 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  49.21 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  44.29 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  49.18 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  41.43 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  39.53 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  46.77 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  44.93 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  45.71 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  47.06 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  39.74 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  39.13 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  45.59 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  36.96 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  39.71 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  43.94 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  42.03 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  45.9 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  42.25 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  39.13 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  38.24 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  45.31 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  47.54 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  40.54 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>