More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3614 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  76.53 
 
 		 98 aa  151  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  68 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  68 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  62.2 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  62.2 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  69.57 
 
 		 76 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  66.67 
 
 		 76 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  66.67 
 
 		 76 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  65.22 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  66.67 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  65.22 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  65.22 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  65.22 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  59.15 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  57.97 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  48.35 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  54.93 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.27 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.5 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.41 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  55.07 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  58.57 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  55.56 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  56.52 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  55.71 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  56.92 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  48.24 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  56.52 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.11 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  47.76 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  55.07 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  52.11 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  53.62 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  50.62 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  52.94 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  44.87 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50.72 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  47.06 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  54.29 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.22 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.7 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  50.7 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  50.7 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  54.29 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  49.38 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  55.88 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  50.72 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.17 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  52.17 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  49.28 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3624  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.687064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  52.17 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  47.83 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  47.83 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.28 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50.72 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  48.57 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  41.56 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.92 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.75 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  55.56 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>