More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4386 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  67.42 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  64.04 
 
 		 94 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  64.44 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  64.44 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  80.6 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  58.82 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  71.83 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  67.65 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  61.64 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  65.22 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  57.53 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.67 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  46.53 
 
 		 214 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  58.82 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  57.75 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  61.54 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  58.57 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  60.29 
 
 		 86 aa  87  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  59.72 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.32 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  57.14 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  59.7 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  54.17 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 73 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 		 75 aa  83.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60.32 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.41 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  52.7 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  45.71 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  58.73 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  58.73 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  47.3 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  53.25 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.22 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  58.21 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  52.56 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.73 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  53.52 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  54.93 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  51.47 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  47.22 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  48.68 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  57.58 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  52.86 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  51.43 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  51.47 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  51.47 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  51.47 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.03 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.03 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  51.47 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.03 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  53.03 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.17 
 
 		 84 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  48.53 
 
 		 77 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  54.55 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  52.24 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.35 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  50.68 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  54.84 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  53.03 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  47.06 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  53.03 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  53.42 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  46.38 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>