More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0311 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  69.44 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  56 
 
 		 96 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  59.72 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  52.44 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  57.95 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  56.16 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  57.58 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  53.93 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  58.73 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  54.79 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  60.29 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  49.35 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  49.37 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  52.7 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  48.15 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  44.19 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  60.66 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  52.11 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  50.7 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.89 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  44.58 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  55.71 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  52.11 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  51.43 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  52.11 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  49.32 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  50.7 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  50.72 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  50.72 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  56.06 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  56.52 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  50.67 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  49.33 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  53.52 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  47.22 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  48.78 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  47.83 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  53.52 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  45.07 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  47.83 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  47.89 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  43.84 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  45.07 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  50.72 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  47.76 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  36.9 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  45.83 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  48.1 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  47.89 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  43.66 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  52.46 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.1 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  52.46 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  43.75 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>