More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3319 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  59.26 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  59.26 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.02 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  61.25 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  59.26 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  58.57 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  62.86 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  60.87 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  62.86 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  60.26 
 
 		 81 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  66.15 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  58.82 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  55.71 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  57.53 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60.29 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  65.15 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  57.53 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  52.11 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  55.84 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  64.18 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  55.71 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  58.57 
 
 		 76 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  60 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.72 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  60.61 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.82 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  60.29 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  54.93 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  53.52 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  58.57 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  60 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  88.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  53.75 
 
 		 83 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  61.54 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  61.54 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  58.46 
 
 		 76 aa  87.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  54.79 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  56.25 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  58.46 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  62.12 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  58.46 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 75 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  58.46 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  58.46 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.38 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.73 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  54.43 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  53.62 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.16 
 
 		 99 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  51.39 
 
 		 74 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  58.46 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.17 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  48.1 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  52.86 
 
 		 214 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  48.1 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.25 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  52.94 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  51.47 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  60 
 
 		 71 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  51.43 
 
 		 206 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  46.05 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  54.29 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  56.52 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  57.58 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  56.52 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  53.42 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  53.42 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>