More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5051 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  171  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  66.23 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  61.04 
 
 
85 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  61.04 
 
 
85 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  61.04 
 
 
85 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  61.04 
 
 
85 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  61.04 
 
 
85 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  63.89 
 
 
110 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  62.03 
 
 
84 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  62.34 
 
 
85 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  63.16 
 
 
84 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  59.74 
 
 
85 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  62.5 
 
 
85 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  62.34 
 
 
84 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  62.82 
 
 
85 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  59.74 
 
 
84 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  62.34 
 
 
84 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  62.34 
 
 
84 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  62.34 
 
 
84 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  61.04 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  61.04 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  60.27 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  60.27 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.41 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  55.41 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  61.76 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  53.09 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  60.61 
 
 
81 aa  94.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  55.41 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  64.71 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  63.24 
 
 
86 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  54.32 
 
 
84 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  55.41 
 
 
81 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  53.25 
 
 
86 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  60.87 
 
 
72 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  61.76 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  55.41 
 
 
81 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  58.82 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  55.41 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  51.35 
 
 
86 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  59.09 
 
 
70 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  61.19 
 
 
80 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  61.54 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  57.75 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.7 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  52.7 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  55.56 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
75 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.35 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  54.17 
 
 
88 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.41 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  55.07 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  54.41 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  60 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  56.52 
 
 
71 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  55.07 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  53.42 
 
 
122 aa  87  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  54.41 
 
 
81 aa  87  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 
72 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  62.71 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50.7 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  60.61 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  62.71 
 
 
71 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  52.86 
 
 
105 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  52.94 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.43 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  52.94 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  52.63 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  52.94 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  45.95 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  58.46 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.7 
 
 
82 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  53.73 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  54.05 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>