More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4114 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  72.45 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  63.44 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  60.23 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  63.22 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  59.55 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  65.38 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  62.37 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  71.21 
 
 		 95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  71.43 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  61.64 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  60 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  60.87 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  57.75 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.94 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  41.11 
 
 		 206 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  52.86 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  45.78 
 
 		 214 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  58.11 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 75 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.41 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  53.25 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  56.92 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  56.06 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  54.79 
 
 		 74 aa  84.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  54.17 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  51.35 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  51.35 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  50.65 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  49.38 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  54.41 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  51.95 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  60.66 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50.75 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  55.74 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  51.9 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  48.68 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  58.82 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  55.74 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  49.23 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  57.35 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  44.12 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  52.86 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  57.38 
 
 		 80 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  47.89 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  54.1 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  54.1 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  52.24 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  54.55 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  49.28 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  48.61 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  52.31 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.61 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50.79 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  48.53 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  54.84 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  54.79 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  50.67 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  55.88 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  46.91 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  45.95 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  47.83 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  50.75 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  50.75 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  50.67 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  50.75 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  50.75 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  45.24 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50.79 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  45.78 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  37.21 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  55.38 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>