More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9388 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  67.11 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  68.42 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  69.01 
 
 
84 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  68.57 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  50.62 
 
 
86 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  65.28 
 
 
110 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  61.43 
 
 
75 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  62.96 
 
 
107 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  62.03 
 
 
91 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  53.75 
 
 
85 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  61.43 
 
 
78 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  61.43 
 
 
78 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  61.43 
 
 
78 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  61.43 
 
 
78 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  61.43 
 
 
77 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  54.43 
 
 
81 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  56.76 
 
 
85 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  66.67 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  60.29 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  66.67 
 
 
104 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  51.9 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  53.75 
 
 
85 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  62.12 
 
 
69 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  51.9 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  51.9 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  66.18 
 
 
99 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  53.16 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  53.16 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  50.63 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  66.18 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  53.16 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.9 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  51.25 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  65.67 
 
 
76 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  57.5 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50.63 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  67.16 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  49.37 
 
 
84 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  51.9 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  62.69 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  61.43 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  60 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  62.32 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  68.18 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  54.17 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  57.14 
 
 
81 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  65.15 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  51.25 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  55.71 
 
 
81 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  51.85 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  61.19 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50.65 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  44.94 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  64.06 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  53.42 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  51.25 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  62.69 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  55.71 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  62.69 
 
 
76 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  62.69 
 
 
76 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  54.05 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  54.05 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  49.37 
 
 
84 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  62.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
130 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  50.6 
 
 
84 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  65.15 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.95 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>